계곡(남천계곡, 선암계곡) 서식어종

• 갈겨니
• 돌고기
• 참종개
• 미유기
• 퉁가리
• 금강모치
• 버들치
• 돌상어

강여울(영춘~단양) 서식어종

• 쏘가리
• 참마자
• 피라미
• 꺽지
• 배가사리
• 여름치
• 줄납자루
• 쉬리
• 새코미꾸리
• 동자개

중하류(시루섬~장회나루) 서식어종

• 모래무지
• 물개
• 누치
• 강준치
• 끄리
• 민물검정망둑